Enamik looduseuurijate seltsi tegevusest toimub erialasektsioonides (vt “allüksused”). Lisaks sektsioonides toimuvale tööle korraldab Eesti LUS Looduseuurijate päeva ja iga kuu viimasel neljapäeval toimuvaid üldkoosolekuid. Oma tegevuse elluviimiseks taotletakse erinevaid projektirahasid ja osaletakse riigihangetes. LUSi liikmed teostavad mitmeid riiklikke eluslooduse seireid ning muid eksperttöid. LUS on teaduste akadeemiaga assotsieerunud akadeemiliste seltside ümarlaua eestvedaja.